6 марта 1913 года состоялось первое буддистское служение в честь 300-летия династии Романовых. Храм для буддистов был построен в Старой Деревне по проекту архитектора Николая Березовского и Гавриила Барановского на пожертвования.
Гранит, позолота, витражи авторства Николая Рериха — дацан получился роскошным и был назван «Источник Святого Учения Всесострадающего Владыки-Отшельника». Однако уже в годы гражданской войны храм разгромили, в 1938 году после ареста лам здание дацана стало собственностью города, а его реликвии сдали в Музей истории религии и атеизма.
До конца 1980-х годов в дацане работали лаборатории Зоологического института, военная радиостанция и физкультурная база. Буддистам храм вернули 9 июля 1990 года.